En teknik för bestämning av bas sekvensen av en homogen polynucleotide som fungerar som en mall i en replikeringssystemet. A liten mängd av en viss dideoxynucleoside trifosfat ingår i de fyra normala deoxynucleotide triphosphates under replikeringen. Kedja uppsägning inträffar när en dideoxynucleotide ingår som genererar en märkta polynucleotide vars kedjans längd, utvärderas av polyakrylamid-gel elektrofores, vittnar om avståndet från 5'-ände primer till positionen som den normala nukleotid sker. Detektering av elektrofores band kan vara av en etikett som ³² P eller, mer nyligen, av en fluorophore införlivas med primer (färgämne primer sekvensering) eller dideoxynucleotide (färgämne terminator sekvensering). i själva verket, i en variant av metoden dye terminator, märkning av varje av de fyra dideoxynucleotides med en fluorophore som släpper ut på en annan våglängd tillstånd identifiering av den bas som avslutar varje elektrofores band inom en separat blandning av alla fyra (enkel lane sekvensering).