En PCR-variant som tillåter viss förstärkning av sekvensen från en enda kända inre sekvens till slutet av fragmentet. Källan DNA klyvs av en begränsning Amiiiiin som lämnar ett överhäng, som fragment är sammanskrivna till en kompatibel universal syntetiska oligonukleotiden duplex kallas en vectorette. Vectorette är konstruerad med en central inkompatibla sekvens och vectorette primer är identisk med sekvensen på vectorette strand som blir sammanskrivna till att fragmentet strand som kan binda en andra primer som är ett komplement till den kända inre sekvensen av fragmentet. Bindningsstället för vectorette primer skapas endast när den interna primern förlängs till utgången av vectorette. Detta undviker dubbelarbete vectorettes bifogas alla andra begränsning fragment. En förfining är splinkerette PCR, där primers är utformade för att bilda hårnål strukturer, vilket minskar risken för icke-specifik priming.