Oppenheimer föddes i Berlin i Tyskland 1899. Hans far var Franz Oppenheimer, en tysk-judisk sociolog och nationalekonom. Mellan 1917 och 1922, Oppenheimer studerade botanik vid universitet i Berlin, Frankfurt och Freiberg i Tyskland och vid universitetet i Wien i Österrike, där han tog sin doktorsgrad.På inbjudan av Selig Suskin Oppenheimer emigrerade till mandatet Palestina 1925, och under några år var aktivt engagerad i försök att upprätta nya bosättningar och dränera träsk runt Zichron Yaacov.In omkring 1931, började han arbeta som en physilogist i avdelningen botanik vid hebreiska universitetet i Jerusalem. Han hjälpte fakulteter för naturvetenskap och jordbruk vid universitetet, och var deras första föreläsare på ämnen i anatomi och fysiologi av anläggningen. Från 1933-1941, Oppenheimer rubriken institutionen för fysiologi och genetik av Agricultural Research Station i Rehovot. Från 1941 till 1953 var han chef för avdelningen för tillväxt av citrus träd och jordbruket botanik, tillsattes som professor 1949. Oppenheimer var dekanus vid fakulteten för jordbruk vid hebreiska universitetet från 1953 och 1954.